Jimmy, un chico que perdió a su familia y no tiene más remedio que convertirse en gángster. Una noche, conoce a una «chica sin nombre» y se ve envuelto en un torbellino de oscuridad y lucha. Los Lakeside Fellows, una banda de vampiros, y los Night Hounds, una organización que los persigue. ¿Cómo sobrevivirán a esta oscuridad un chico sin nada y una chica con un duro destino? Hombres lobo, gangsters, vampiros...

Después de la guerra, hay muchos "Extendidos" en la ciudad, personas cuyos cuerpos fueron modificados para convertirlos en armas peligrosas. Inui Juuzou es uno de ellos, y no tiene recuerdos de su vida y cuerpo antes de que su cabeza se transformara en un arma. Por extraño que parezca, está diseñado para que sólo alguien que él acepte pueda apretar el gatillo. Juuzou se gana la vida mediante tomando los casos que involucran a los "Extendidos" en la ciudad, y es asistido por María, una joven inteligente que ha tomado bajo su protección.

En un pueblo afectado por la despoblación rural, un cultivador llamado Keita crea una nueva especie de higo que consigue recomendar una celebridad de Internet. La economía local empieza a repuntar gracias a la exposición mediática, lo que da esperanzas a Keita para que la escuela local vuelva a abrir, y así convencer a su mujer de que regrese con su hija. Sin embargo, la vida cotidiana en este apacible pueblo se ve alterada por la llegada de un extraño, Suzuki Mutsuo, que aparentemente busca empleo. Keita no se fía del astuto hombre, y sus dudas se confirman cuando su mejor amigo le informa de que ha reconocido al desconocido: condenado hace varios años por un caso de acoso y asesinato, ¡es un criminal recién salido de la cárcel!

Un año después del final de Persona 4, Naoto es invitado a investigar las misteriosas desapariciones de dos estudiantes Yagakoro por un viejo amigo detective, Touko Aoi. Allí, se ha asociado con Sousei Kurogami, un detective mecánico y un polo opuesto a ella en términos de personalidad y metodología. En su primer encuentro, ella despierta a una nueva persona Amatsu Mikaboshi, que le permite amplificar la habilidad de Persona Sousei, Tsukuyomi. Junto con Sousei, descubre que el sito Midnight, un sitio anónimo donde el juicio se transmite a otros por cinco jueces que llevan el nombre de figuras de la mitología japonesa: Uzume, Sarutahiko, Omoikane, Tajikarao y Futotama.

Tras ser traicionado y asesinado por la organización en la que trabajaba, el infame asesino Bi-Gwang se reencarna en Kim Gyeongsoo, un agente de policía. Jura vengarse de Hwaguksa, la organización de asesinos que le ha traicionado.

La historia está ambientada en un distópico futuro donde el calentamiento global ha devastado la mayor parte de la tierra y el mundo está sufriendo de una depresión económica que llevó a un aumento de la delincuencia. La historia se centra alrededor de Saiga Riki-Oh, bendito con fuerza inhumana, que, después de tomar venganza contra un yakuza que era responsable de la muerte de un niño que se hizo amigo de él (en la película, que era su novia que murió), termina en una prisión de máxima seguridad de propiedad de una organización privada. La historia sigue a Riki y la búsqueda de su hermano pequeño Saiga Nachi, que lleva un símbolo Manji en su mano derecha y también posee una fuerza sobrehumana.

Rokudou es un perdedor, y todo el mundo lo sabe. Es acosado en la escuela, recibe punzantes miradas del resto de la gente, y sólo puede reunir el valor para quejarse en secreto con sus también desdichados amigos. Intentando cambiar su vida, desesperadamente usa un artefacto ancestral transmitido en su familia por generaciónes: Un pergamino que es capaz de someter a todos los demonios. Sin embargo, en la era moderna, tiene un efecto diferente-- Hace que todas las chicas malas se enamoren de él.

Se-young, fue agredido por ocho de sus compañeros de clase en la escuela secundaria Nunggwang... Luego de nueve meses se despierta solo para descubrir que sus padres se han suicidado para asi resolver su opresión.... Como resultado, el caso de asalto fue revisado y los perpetradores del caso fueron castigados, pero la ira y el miedo al mundo no desaparecieron.... Se-young se esconde del exterior.... hasta que un día al salir por la puerta, se escucha un sonido extraño.... “Es muy simple ser fuerte, solo corre con una espada y balanceala hasta estar agotado. Eso es todo." Asi, Se-young comienza con su alegre venganza.

Tras ser secuestrada, una chica desgraciada es feliz por primera vez. El día que la secuestran empieza una vida con un hilo de esperanza. Ella le promete a su secuestrador que se casarán y él le ofrece felicidad. ¿Cómo pueden tener una relación tan cálida siendo un secuestrador y su víctima?

Nana Kaneda, un joven preparatoriano al cual le diagnostican amnesia inducida por un trauma después de descubrir el cuerpo muerto de su compañera y amiga, Hiwako Shima. Después de ser dado de alta del hospital, es recogido por un misterioso benefactor. Nana vuelve a la escuela y trata de reconstruir sus recuerdos perdidos. ¡Pero para confundir más las cosas, sus recuerdos enterrados han adoptado la forma de un ser surrealista, cuya cabeza tiene la forma de una luna creciente! Ahora, tanto este ser misterioso como Nana se ponen en marcha para resolver el misterio del asesinato de Hiwako.