Theo fue forzado a un matrimonio político por orden del Imperio, pero para su sorpresa, se enamora a primera vista de su esposa, Yuellina - la mujer a la que ha arrastrado a regañadientes a esta unión. Sin embargo, Yuellina está destinada a sacrificarse por el Imperio. ¿Podrá Theo salvarla de este cruel destino y pasar el resto de su vida a su lado?

Hace diez años, la misteriosa Puerta del Infierno se materializó repentinamente en el centro de Tokio, y las estrellas del cielo de la noche se oscurece en la oscuridad. En su lugar, surgieron nuevas estrellas, cada una correspondiente a un individuo dotado de habilidades sobrenaturales. Desprovisto de la emoción y la conciencia, estos poderosos asesinos han llegado a ser conocido como contratistas. Pero la mayoría de la gente no sabe nada de los Contratistas en medio de ellos, y de preparatoria Kana Shinoh no es una excepción. Todavía luchando para recoger los pedazos después de la muerte de su padre el año pasado, Kana nunca ha preocupado a sí misma con los rumores sobre la puerta del infierno. Es decir, hasta que ella descubre a su padre en la calle un día. Decidido a probar su padre aún está vivo, Kana comienza su búsqueda, pero su misión está atrayendo la atención bastante peligroso. Afortunadamente, es rescatada de las garras de la muerte por Hei, el contratista más buscado en To

La historia se desarrolla un año después del final de la primera temporada del anime y antes de las ovas (Darker than Black: Gaiden). En esta historia Hei y Yin huyen del sindicato mientras se enfrentan a un contratista llamado Harvest el cuál tiene el poder de convertir a las personas en contratistas con la ayuda de una flor Diente de León Negro.

Una serie de eventos relacionados ocurren en el Mundo Abandonado después de una catástrofe. Las personas que fueron dotadas de un poder misterioso después de ese fatídico día se ven obligadas a enfrentarse entre sí, sin darse cuenta de que son solo peones en un juego más grande. El mundo familiar y comprensible se convierte en una locura y una carrera por la supervivencia. Las sombras de los enemigos se vuelven parte de las tuyas. Cualquier acción, mirada y palabra se reflejan en el destino como una sentencia. Y cuando te enfrentas a tus miedos, tienes que buscar respuestas. Cuando te das cuenta de que nada se puede devolver, lo único que queda es seguir adelante, tratando de encontrar el camino correcto ... que tal vez ni siquiera exista.

La historia se desarrolla en un futuro distante donde la tierra esta arruinada y la humanidad se ha establecido en un fuerte móvil llamado Ciudad Plantation. Los pilotos producidos dentro de las Plantation viven en Mistilteinn también conocida como "la jaula de pájaros," los niños viven ahí ignorando por completo el mundo exterior o la libertad del cielo. Sus vidas consisten en realizar misiones en contra de sus enemigos, quienes son unas formas de vida gigantes y misteriosas llamadas "Klaxosaurios" y son los niños quienes pilotean los robots FranXX los cuales deben enfrentarse a ellos. Para los niños montar a los FranXX no es mas que una prueba de su existencia. Un chico llamado código 016 (Hiro), fue alguna vez conocido como un prodigio, sin embargo, se ha quedado detrás y su existencia parece ser innecesaria. "No pilotear un FranXX es lo mismo que dejar de existir." El día que está por abandonar Mistilteinn, una misteriosa chica conocida como "Zero Two" aparece frente a el en lago de la Plantation, con dos cuernos en su cabeza...

Después de asistir a un Freak Show, o espectáculo de fenómenos, conocido como "Circo de los Horrores", un chico llamado Darren Shan se siente tentado a robar una gran tarántula del domador de arañas y revelado vampiro, Larten Crepsley. Aprende cómo controlarla a través de la telepatía, pero mientras practicaba con su mejor amigo, Steve Leonard, la araña se asusta y muerde el cuello a Steve. Aunque el mordisco no le mata, Steve queda paralizado y Darren busca a Crepsely con la esperanza de obtener un antídoto para su amigo. Crepsley acepta dárselo con la condición de convertir a Darren en vampiro; Darren acepta, y se ve convertido en medio-vampiro salvando así a su amigo Steve. Inmediatamente después, Darren huye de Crepsley, con el temor de perder su estilo de vida, sus amigos y familia.

El estudiante de preparatoria Kaname Sudou recibe una invitación de un compañero para jugar a Darwin's Game, un juego para móvil del que nunca ha oído hablar. Sin embargo, en cuanto abre la aplicación, una serpiente verde aparece repentinamente de la pantalla de su teléfono y le muerde el cuello, dejándolo inconsciente. Al despertar en la enfermería sin ninguna señal de mordedura de serpiente, la escuela le dice que se tome el resto del día libre. Aunque está desconcertado por lo sucedido, considera la experiencia surrealista una alucinación y sube al tren a casa. Desafortunadamente, la curiosidad lo vence y vuelve a usar la aplicación. Como la aplicación parece ser como cualquier otro juego de batalla, Kaname exhala un suspiro de alivio y decide empezar su primera partida. Sin embargo, la grata sorpresa dura poco, ya que su oponente en el juego aparece inesperadamente justo delante de él e intenta cazarlo con un cuchillo. Mientras corre desesperadamente por su vida, Kaname ata dos y dos y se da cuenta de que el Juego de Darwin no es un juego común, sino una lucha brutal por la supervivencia.

Souma es una extraña chica que huye con su moto hasta que encuentra que un joven ha tenido un accidente. Ambos se irán conociendo poco a poco y descubrirán que tienen más en común de lo que parece.

Ganta Igarashi ha sido condenado por el asesinato de toda su clase de secundaria, un crimen que no ha cometido. Sentenciado a muerte, es enviado a la nueva prisión, "Deadman Wonderland", donde los prisioneros son la atracción principal de unos brutales juegos de supervivencia.

El estudiante Jun que vive en Aomori quiere convertirse en un director de anime. El estaba muy indeciso de que camino escoger pero el reflexiono y eligió el camino del anime.